Nor Varagavank est situé dans la province de Tavush, au sud-ouest du village de Varagavan, sur le versant d’une montagne boisée. Dans les sources médiévales, il était initialement connu sous le nom d’Anapat. Le monastère constituait l’un des centres spirituels et l’un des lieux de sépulture dynastiques des princes Kyurikian de Nor Berd. Hrachya Kartashyan considère ce complexe comme l’un des ensembles les plus caractéristiques de l’architecture arménienne des XIIe et XIIIe siècles, associant sa phase principale de construction à Davit II, l’un des derniers représentants de la dynastie des Kyurikian, et à son fils Vasak.
Un village existait déjà sur le site du monastère au XIIe siècle. Le complexe monastique se compose de deux églises, d’une chapelle funéraire, d’une chapelle et de deux porches.
La structure la plus ancienne du monastère est l’église d’Anapat, construite par le prince Davit en 1198. Il s’agit d’une petite église à nef unique surmontée d’une voûte en berceau, mais elle présente une particularité inhabituelle : le sanctuaire oriental est divisé par une cloison en deux espaces d’autel inégaux. Sa seule entrée se trouve sur la façade ouest, flanquée de deux khachkars ornés. L’église était parfois appelée Surb Nshan, ou « église du Saint-Signe », probablement parce que le Saint-Signe de Varag y était conservé.
La structure principale du complexe est l’église de la Sainte Mère de Dieu. De forme rectangulaire à l’extérieur et cruciforme à l’intérieur, il s’agit d’une salle surmontée d’un dôme et dotée de quatre sacristies à deux étages. L’une des inscriptions situées à l’entrée ouest est datée de 1224, tandis qu’une autre indique que la construction de l’église s’est achevée en 1237. Dans ces deux inscriptions, Vasak, fils du prince Davit, est mentionné comme le mécène à l’origine de sa construction. Une inscription conservée dans le sanctuaire indique « MAÎTRE GAZAN D’ANI », ce qui a conduit les spécialistes à suggérer que Gazan était l’architecte de l’église.
Le grand porche situé du côté ouest est le dernier élément majeur ajouté au complexe. Il est considéré comme l’un des plus grands porches arméniens de ce type.
À environ 100 mètres au sud-ouest des bâtiments principaux se dressent deux chapelles distinctes. Un cimetière médiéval s’étend autour d’elles. Autrefois, des vestiges du mur d’enceinte du monastère et des cellules des moines étaient également conservés.