Монастырь Нор-Варагаван расположен в провинции Тавуш, к юго-западу от села Варагаван, на склоне покрытой лесом горы. В средневековых источниках он первоначально упоминался под названием Анапат. Монастырь служил одним из духовных центров и династическим местом захоронения князей Кюрикиан из Нор-Берда. Храчья Карташян считает этот комплекс одним из самобытных ансамблей армянской архитектуры XII–XIII веков, связывая его основной этап строительства с Давидом II, одним из последних представителей династии Кюрикиан, и его сыном Васаком.
Еще в XII веке на месте монастыря существовало поселение. Монастырский комплекс состоит из двух церквей, погребальной часовни, молельни и двух притворов.
Самым ранним датированным сооружением монастыря является церковь Анапат, построенная князем Давидом в 1198 году. Это небольшая однонефная церковь с цилиндрическим сводом, но она имеет необычную особенность: восточное святилище разделено перегородкой на два неравных алтарных пространства. Единственный вход в церковь расположен на западном фасаде, по обе стороны от которого установлены украшенные хачкары. Иногда церковь называли Сурб Ншан, или Церковь Святого Знамения, вероятно, потому что здесь хранилось Святое Знамение Варага.
Главным сооружением комплекса является церковь Пресвятой Богородицы. Снаружи она имеет прямоугольную форму, а внутри — крестообразную; представляет собой купольный зал с четырьмя двухэтажными ризницами. Одна из надписей у западного входа датирована 1224 годом, а другая гласит, что строительство церкви было завершено в 1237 году. В обеих надписях в качестве мецената, ответственного за строительство, упоминается Васак, сын князя Давида. Надпись, сохранившаяся в святилище, гласит: «МАСТЕР ГАЗАН ИЗ АНИ», что позволяет учёным предположить, что Газан был архитектором церкви.
Большой притвор с западной стороны является последним крупным сооружением, добавленным к комплексу. Он считается одним из крупнейших армянских притворов такого типа.
Примерно в 100 метрах к юго-западу от главных зданий стоят две отдельные часовни. Вокруг них раскинулось средневековое кладбище. В прошлом здесь также сохранились остатки ограждающей стены монастыря и келий монахов.