Le monastère de Kobayr est situé dans la région de Lori, près du village de Kobayr, à l'ouest de la gare de Kober, sur le versant gauche des gorges du Debed. Les édifices du complexe sont érigés sur des terrasses de hauteurs variables creusées dans la roche. On y trouve encore des vestiges d'églises, de chapelles, d'un mur d'enceinte, d'un réfectoire et de bâtiments laïques.
Le bâtiment le plus ancien du complexe est l’église Mariamashen. Une inscription gravée dans le linteau de l’entrée ouest indique qu’elle a été construite en 1171 par Mariam, fille du roi Kyurike II. L’église est à nef unique et était couverte d’une voûte semi-cylindrique. La fenêtre ronde au-dessus de l’entrée est entourée d’anneaux sculptés décoratifs, et au-dessus d’elle est sculptée une croix à bras égaux inscrite dans un cercle.
En 1279, un clocher-mausolée à arc ouvert fut construit dans le complexe. Une inscription géorgienne conservée sur son mur sud mentionne le fils de Shahnshah et son épouse, Vaneni. Sous le règne des Zakaryan, Kobayr servit également de lieu de sépulture à la famille princière.
À l’entrée du clocher, une abréviation grecque de trois lettres est gravée, dérivée du mot grec signifiant « église ».
La Grande Église fut construite à la fin du XIIe siècle sur l’esplanade sud-est du complexe. Une partie importante de l’abside, des murs nord et ouest, ainsi que les rangées inférieures du mur sud ont été conservées. L’intérieur des murs en basalte était enduit et peint. Des fragments de peintures murales sont encore visibles aujourd’hui dans l’abside et sur le mur nord de l’esplanade.
Les peintures murales de Kobayr comptent parmi les rares exemples conservés de la peinture monumentale arménienne du XIIIe siècle. L’historienne de l’art Irina Drampian y a identifié une structure compositionnelle plane, un mouvement sobre des figures, des contours marqués et un style chrétien oriental.
D’après les recherches de Tamara Dadayan, Kobayr représente le thème rituel du « Souper mystique » avec une scène de communion. La composition est divisée en deux parties symétriques, et le Christ y est représenté deux fois, distribuant la communion aux apôtres de part et d’autre.
À Kobayr, l’architecture, les inscriptions arméniennes et géorgiennes ainsi que la peinture murale se rejoignent en un seul et même lieu, reflétant les interactions politiques, religieuses et artistiques de la région de Lori aux XIIe et XIIIe siècles.
